依据《建设项目竣工环境保护验收暂行办法》第六条及第十四条规定，需要对建设项目配套建设的环境保护设施进行调试的，建设单位应当确保调试期间污染物排放符合国家和地方有关污染物排放标准和排污许可等相关管理规定。环境保护设施未与主体工程同时建成的，或者应当取得排污许可证但未取得的，建设单位不得对该建设项目环境保护设施进行调试。
纳入排污许可管理的建设项目，排污单位应当在项目产生实际污染物排放之前，按照国家排污许可有关管理规定要求，申请排污许可证，不得无证排污或不按证排污。建设项目验收报告中与污染物排放相关的主要内容应当纳入该项目验收完成当年排污许可证执行年报。因此，必须申领排污许可证后方可进行调试、竣工环保验收监测及自主验收程序。
根据《中华人民共和国环境影响评价法》有关规定，环评应在项目开工前完成。根据《关于做好环境影响评价制度与排污许可制衔接相关工作的通知》，环境影响评价制度是建设项目的环境准入门槛，是申请排污许可证的前提和依据。
企业新建项目在试运行阶段，可能会产生实际的排污行为。根据相关法律要求，企业必须持证排污，不得无证排污。因此，企业在投入运行并产生实际的排污行为之前，应当取得排污许可证。这跟企业是否通过环保验收没有必然的关系。
综上，可以总结出以下这个流程：环评编制——取得环评批复（或完成登记表备案）——申请排污许可证——编制环境风险应急预案——试运行——开展竣工环保验收——完成自主验收——正式投产。
环评出问题，建设单位被罚50万，主管人和责任人也被罚5万及以上不等
杭州市生态环境局发现某公司建设项目环评文件的“主要环境保护目标”部分内容、营运期废气污染物分析的“销售汽油、柴油量”与事实不符。随后组织专家对该项目环境影响报告表的质量问题进行复核，发现该环评文件中还存在大气环境影响评价范围内遗漏“两江一湖”风景名胜区保护目标、未按导则要求开展声环境影响分析等严重质量问题。后经进一步调查，公司在编制过程中未按实际情况对相应数据进行修改，评价范围内遗漏“两江一湖”风景名胜区保护目标，未按导则要求开展声环境影响分析。当事人对编制内容全程参与，并对环评内容审核且进行确认后报批。
杭州市生态环境局认为当事人报批的环评文件中存在项目拟建地址显示图与事实不符、大气环境影响评价范围内遗漏“两江一湖”风景名胜区保护目标, 未按导则要求开展声环境影响分析等严重质量问题情形，违反了《中华人民共和国环境影响评价法》第十九条第二款“编制建设项目环境影响报告书、环境影响报告表应当遵守国家有关环境影响评价标准、技术规范等规定”、第二十条第一款“建设单位应当对建设项目环境影响报告书、环境影响报告表的内容和结论负责，接受委托编制建设项目环境影响报告书、环境影响报告表的技术单位对其编制的建设项目环境影响报告书、环境影响报告表承担相应责任。”；的规定，依据《中华人民共和国环境影响评价法》第三十二条第一款“建设项目环境影响报告书、环境影响报告表存在基础资料明显不实，内容存在重大缺陷、遗漏或者虚假，环境影响评价结论不正确或者不合理等严重质量问题的，由设区的市级以上人民政府生态环境主管部门对建设单位处五十万元以上二百万元以下的罚款，并对建设单位的法定代表人、主要负责人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处五万元以上二十万元以下的罚款。”的规定，根据当事人的整改情况和《浙江省生态环境行政处罚裁量基准规定》第十一条第一款第（四）项、第二款，符合从轻处罚情形，经集体审议，决定处罚如下：
罚款人民币伍拾万元整；
直接负责的主管人员***罚款人民币伍万陆仟元整；
其他直接责任人员**罚款人民币伍万元整。
当事人在收到本行政处罚决定书之日起15日内需缴纳罚款。逾期不缴纳，依据《中华人民共和国行政处罚法》第五十一条第一项规定每日按罚款数额的3%加处罚款。如不提起诉讼、又不履行本行政处罚决定，本局将依法申请人民法院强制执行。
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